RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 C2orf70A6NJV1 201 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 LHBP01229 141 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PYYP10082 97 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CKS1BP61024 79 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PRR20EP86478 221 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PRR20CP86479 221 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PRR20DP86480 221 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PRR20BP86481 221 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PRR20AP86496 221 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 JMJD8Q96S16 334 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 ITPR1Q14643 2758 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 PET117Q6UWS5 81 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 HARBI1Q96MB7 349 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 AP1S3Q96PC3 154 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 V9GYV3 84 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 KIR2DS2P43631 304 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 CX3CL1P78423 397 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-216ENST00000596536 H3BTX0 84 aa8.65□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.65□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 FAM168AQ92567 244 aa8.65□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 CCL17Q92583 94 aa8.65□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.65□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 K7EP34 96 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 UPK2O00526 184 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 APCSP02743 223 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 LY6DQ14210 128 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 RTL8BQ17RB0 113 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 DYSFO75923 2080 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 NBL1P41271 181 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 UQCRFS1P47985 274 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 CR1LQ2VPA4 569 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 TIGITQ495A1 244 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 PRNDQ9UKY0 176 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 H3BUT2 72 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 HLA-DQA1P01909 254 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 AMY1AP04745 511 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 PRCDQ00LT1 54 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 FAM222BQ8WU58 562 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.038e-7■■■■□ 20.6
FCHO1-216ENST00000596536 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 CD24P25063 80 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 GPR183P32249 361 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 HSD52Q0P140 79 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 CFHR2P36980 270 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 SLAQ13239 276 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 FOXE3Q13461 319 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 HCP5Q6MZN7 132 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 BLNKQ8WV28 456 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 NPIPB3Q92617 1050 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 SMIM17P0DL12 118 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 AREGP15514 252 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 CD40P25942 277 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 GNG5P63218 68 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 C9orf118A6NHY6 69 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 MOSP00540 346 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 USF1P22415 310 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 COX19Q49B96 90 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-216ENST00000596536 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.6 ms