RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAX2	Q96IS3	184 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	CITED1	Q99966	193 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPRM	Q9NS64	109 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF320	A2RRD8	509 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5G3	P0C626	314 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	DPF1	Q92782	380 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	UHRF2	Q96PU4	802 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFA4	O00483	81 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	APOC3	P02656	99 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZP3	P21754	424 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLURP1	P55000	103 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLLU1	Q5K131	121 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	PATE2	Q6UY27	113 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00052	Q96N35	136 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC01619	G3V211	115 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCL24	O00175	119 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	COX7A2P2	O60397	106 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	HYPM	O75409	117 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYNJ2BP	P57105	145 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLP1	P60201	277 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPHB5	Q86YW7	130 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	UMAD1	C9J7I0	102 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	MB	P02144	154 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SULT1A2	P50226	295 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	FHL3	Q13643	280 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM78B	Q5VT40	261 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	MORN5	Q5VZ52	161 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	C3orf56	Q8N813	242 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	PFDN5	Q99471	154 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKR1D1	P51857	326 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	TM4SF20	Q53R12	229 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC25A22	Q9H936	323 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		7	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB5C	P51148	216 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	S100A12	P80511	92 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF726P1	Q15940	193 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	LEMD1	Q68G75	181 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF141	Q8WVD5	230 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	C12orf57	Q99622	126 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF747	Q9BV97	191 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RABAC1	Q9UI14	185 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSX7	Q7RTT5	188 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	METTL26	Q96S19	204 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PPV4	95 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	EDN2	P20800	178 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPPC	P23582	126 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RHOB	P62745	196 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1QL4	Q86Z23	238 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB24	Q969Q5	203 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM213	A2RRL7	107 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	FUT9	Q9Y231	359 aa		6.98	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms