RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591376.5

CIRBP-232, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 830 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 SLC25A6P12236 298 aa13.16□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 LRTM2Q8N967 370 aa13.16□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 TRIM63Q969Q1 353 aa13.16□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.16□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 TMEM189A5PLL7 270 aa13.15□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 SMIM9A6NGZ8 99 aa13.15□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.15□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 EMP1P54849 157 aa13.15□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 RPP30P78346 268 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 GSG1LQ6UXU4 331 aa13.15□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 THAP8Q8NA92 274 aa13.15□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 TMED3Q9Y3Q3 217 aa13.15□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 HERC2O95714 4834 aa13.15□□□□□ -0.3
CIRBP-232ENST00000591376 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 ISLRO14498 428 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 CFDP00746 253 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 P0DMU3 169 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 FAM231AP0DMU4 169 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 FAM231CP0DMU5 169 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF709Q8N972 641 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 MAGT1Q9H0U3 335 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SLC35B3Q9H1N7 401 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 RFNGQ9Y644 331 aa13.14□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 CCDC160A6NGH7 325 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 WRBO00258 174 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SYNGR2O43760 224 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SFT2D2O95562 160 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 PSG9Q00887 426 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF79Q15937 498 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 GGNBP1Q5YKI7 109 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 C16orf92Q96LL3 132 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SLC25A22Q9H936 323 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 V9GYH0 126 aa13.13□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 F6UB75 175 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 HOXB5P09067 269 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 S100A5P33763 92 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 GALR1P47211 349 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 MEOX2P50222 304 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 PAX9P55771 341 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 PPP1R1AQ13522 171 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 FAM78BQ5VT40 261 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 DEDD2Q8WXF8 326 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SLC25A32Q9H2D1 315 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 RPRMQ9NS64 109 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.12□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 A0A0J9YX75 114 aa13.11□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.11□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 PRSS46E5RG02 174 aa13.11□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SPANXN5Q5MJ07 72 aa13.11□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.11□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 BPIFCQ8NFQ6 507 aa13.11□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 SLC45A2Q9UMX9 530 aa13.11□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF98A6NK75 572 aa13.1□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 HBE1P02100 147 aa13.1□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 ORM2P19652 201 aa13.1□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 AKR1C1Q04828 323 aa13.1□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 FAM222AQ5U5X8 452 aa13.1□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 C20orf173Q96LM9 149 aa13.1□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa13.1□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 RSG1Q9BU20 258 aa13.1□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 DKK2Q9UBU2 259 aa13.1□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 H3BP45 60 aa13.09□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 S100A7P31151 101 aa13.09□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 OR1B1Q8NGR6 318 aa13.09□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 TMEM147Q9BVK8 224 aa13.09□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 DOK5Q9P104 306 aa13.09□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CIRBP-232ENST00000591376 DNAH2Q9P225 4427 aa13.08□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa13.08□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.08□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 OR4D5Q8NGN0 318 aa13.08□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 GPR82Q96P67 336 aa13.08□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.08□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13.08□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 M0R2N4 97 aa13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 IFNA21P01568 189 aa13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 RRN3P1Q2M238 152 aa13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 CCDC190Q86UF4 302 aa13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 FAM210BQ96KR6 192 aa13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 TMEM208Q9BTX3 173 aa13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 FAT2Q9NYQ8 4349 aa13.07□□□□□ -0.32
CIRBP-232ENST00000591376 SMCO3A2RU48 225 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.5 ms