RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 MYOD1P15172 320 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 M6PRP20645 277 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 S100A1P23297 94 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 PSMB8P28062 276 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 MEOX2P50222 304 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 RND2P52198 227 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 RHOBP62745 196 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 NDPQ00604 133 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CFHR3Q02985 330 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF616Q08AN1 781 aa5.71□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.71□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.71□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.71□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.71□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 AGPAT2O15120 278 aa5.7□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 TOMM40O96008 361 aa5.7□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 ATP6V0CP27449 155 aa5.7□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 RUNX1Q01196 453 aa5.7□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 Q6ZSV7 163 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 OR5AU1Q8NGC0 362 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.7□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 K7EMT4 169 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 M0QZ24 198 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 LINC00869P0C866 280 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CDKN1BP46527 198 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 FHITP49789 147 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 MFAP2P55001 183 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CT83Q5H943 113 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 STPG3Q8N7X2 389 aa5.68□□□□□ -1.5
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