RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 DEFA3P59666 94 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 ERVFC1-1P60608 527 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 OR5I1Q13606 314 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 MCFD2Q8NI22 146 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A0J9YY99 117 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 M0R2Z0 102 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 ISLRO14498 428 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC25A4P12235 298 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SDC2P34741 201 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 HRH1P35367 487 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TAS2R46P59540 309 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 MXD1Q05195 221 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 RGS21Q2M5E4 152 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 IDNKQ5T6J7 187 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 NPIPB3Q92617 1050 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 RNF125Q96EQ8 232 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 ENY2Q9NPA8 101 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 RPRMQ9NS64 109 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 DOK5Q9P104 306 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A087WTM6 91 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A0G2JRQ6 117 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 INSP01308 110 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 HOXA5P20719 270 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 GCSHP23434 173 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 HLA-DMAP28067 261 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 S100GP29377 79 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 HTR2BP41595 481 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 UCP3P55916 312 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 B2MP61769 119 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 C2orf83Q53S99 150 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 BAP18Q8IXM2 172 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SYT8Q8NBV8 401 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TP53RKQ96S44 253 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 APOA1P02647 267 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 M6PRP20645 277 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 AKR1C2P52895 323 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SPCS3P61009 180 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 VBP1P61758 197 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TSPAN5P62079 268 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 ACY3Q96HD9 319 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 LINC01587Q99440 93 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SIVA1O15304 175 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 PTTG1O95997 202 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 HTN1P15515 57 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF90Q03938 601 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 SPCS2Q15005 226 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 AARDQ4LEZ3 155 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 OR52E5Q8NH55 327 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 C16orf74Q96GX8 76 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 C16orf92Q96LL3 132 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTA-217ENST00000560521 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A096LPF7 62 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 H3BNG1 76 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 PI3P19957 117 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 UCP1P25874 307 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 TAS2R60P59551 318 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 RND3P61587 244 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 NCS1P62166 190 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 SP6Q3SY56 376 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTA-217ENST00000560521 UPK1BO75841 260 aa6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms