RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	INSL3	P51460	131 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	SYNJ2BP	P57105	145 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	AKR1C1	Q04828	323 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	THAP8	Q8NA92	274 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	TRGV9	Q99603	122 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	PEMT	Q9UBM1	199 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NUMB-231	ENST00000559312	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ZFP92	A6NM28	416 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	CCNK	O75909	580 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	TOMM40	O96008	361 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	SELENOT	P62341	195 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ARL16	Q0P5N6	197 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	VWC2	Q2TAL6	325 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF575	Q86XF7	245 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312		Q8WTZ3	238 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	AQP10	Q96PS8	301 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	GINS3	Q9BRX5	216 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF320	A2RRD8	509 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	SMCO3	A2RU48	225 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312		K7EMT4	169 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	MPDU1	O75352	247 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	RD3L	P0DJH9	198 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	RAB31	Q13636	194 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	TIGIT	Q495A1	244 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312		Q5BKY6	102 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF546	Q86UE3	836 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	MARC2	Q969Z3	335 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	HSPB11	Q9Y547	144 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM213	A2RRL7	107 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	C2orf70	A6NJV1	201 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	HMSD	A8MTL9	139 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312		G3V3Q6	166 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	DFFB	O76075	338 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	YIF1A	O95070	293 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	PSG1	P11464	419 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	BMI1	P35226	326 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF90	Q03938	601 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	AKAP14	Q86UN6	197 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ATP5S	Q99766	215 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	RNF222	A6NCQ9	220 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	SAP30	O75446	220 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	IL4	P05112	153 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	CSN3	P07498	182 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	C8orf88	P0DMB2	117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	CBLN1	P23435	193 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	NPPC	P23582	126 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	S100A7	P31151	101 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF266	Q14584	549 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF345	Q14585	488 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	CLINT1	Q14677	625 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	BTNL8	Q6UX41	500 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	RNF125	Q96EQ8	232 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	METTL26	Q96S19	204 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NUMB-231	ENST00000559312	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5

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