RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557172.5

KLC1-223, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 4

Gene KLC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-223	ENST00000557172	RNF2	Q99496	336 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	VSIR	Q9H7M9	311 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RPRM	Q9NS64	109 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172		A0A1W2PPV4	95 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172		K7EMT4	169 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	LGALS9	O00182	355 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	NPPC	P23582	126 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	MYCNOS	P40205	109 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RAB2A	P61019	212 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RHOB	P62745	196 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	DEFB136	Q30KP8	78 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	C3orf56	Q8N813	242 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RAX2	Q96IS3	184 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	CITED1	Q99966	193 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF747	Q9BV97	191 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	DOK5	Q9P104	306 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RABAC1	Q9UI14	185 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ANK2	Q01484	3957 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SYNJ2BP	P57105	145 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	BLOC1S1	P78537	153 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	FAM78B	Q5VT40	261 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	REC114	Q7Z4M0	266 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	C1QL4	Q86Z23	238 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	DUX3	Q96PT4	197 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	METTL26	Q96S19	204 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RNF24	Q9Y225	148 aa		7.49	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	CRYBB3	P26998	211 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	FHIT	P49789	147 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SLURP1	P55000	103 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RAB14	P61106	215 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	FHL3	Q13643	280 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	TM4SF20	Q53R12	229 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RAB24	Q969Q5	203 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	OR4F4	Q96R69	305 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	FUT9	Q9Y231	359 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172		U3KQE9	123 aa		7.48	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172		A0A1W2PS18	150 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF98	A6NK75	572 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	C8orf88	P0DMB2	117 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	TAS2R45	P59539	299 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	MARC2	Q969Z3	335 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	UHRF2	Q96PU4	802 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	PEMT	Q9UBM1	199 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SMPX	Q9UHP9	88 aa		7.47	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		7.46	□□□□□ -1.22
KLC1-223	ENST00000557172	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		7.46	□□□□□ -1.22
KLC1-223	ENST00000557172	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		7.46	□□□□□ -1.22
KLC1-223	ENST00000557172		A8MWP6	167 aa		7.46	□□□□□ -1.22
KLC1-223	ENST00000557172		H3BRN7	92 aa		7.46	□□□□□ -1.22
KLC1-223	ENST00000557172	TEX46	H3BTG2	121 aa		7.46	□□□□□ -1.22
KLC1-223	ENST00000557172	RGS13	O14921	159 aa		7.46	□□□□□ -1.22
KLC1-223	ENST00000557172	BUB3	O43684	328 aa		7.46	□□□□□ -1.22
KLC1-223	ENST00000557172	BMI1	P35226	326 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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