RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	DISC1	C4P0D8	188 aa		8.88	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	ISLR	O14498	428 aa		8.88	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	8.88	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2F1	Q13607	317 aa		8.88	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	RRN3P1	Q2M238	152 aa		8.88	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		8.88	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		8.88	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	IL22RA2	Q969J5	263 aa		8.88	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	8.88	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		8.88	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	PRM2	P04554	102 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	AKAIN1	P0CW23	69 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	DAD1	P61803	113 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	TNP2	Q05952	138 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SMCO1	Q147U7	214 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	AMTN	Q6UX39	209 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC35E1	Q96K37	410 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	C17orf77	Q96MU5	243 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		8.87	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931		A8MTW9	85 aa		8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	CTDSP2	O14595	271 aa		8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	CCR6	P51684	374 aa		8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	RPRM	Q9NS64	109 aa		8.86	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A0B4J2A0	478 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	RGS5	O15539	181 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	C16orf92	Q96LL3	132 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	TRGV9	Q99603	122 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	PRRT1	Q99946	306 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	DOK5	Q9P104	306 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		8.85	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	C16orf90	A8MZG2	172 aa		8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931		M0R2Z0	102 aa		8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	FABP1	P07148	127 aa		8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SMIM18	P0DKX4	95 aa		8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	THAP8	Q8NA92	274 aa		8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	ATG101	Q9BSB4	218 aa		8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A22	Q9H936	323 aa		8.84	□□□□□ -0.99
LETMD1-231	ENST00000551931	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	CDK2AP2	O75956	126 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	IAPP	P10997	89 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	AKR1C4	P17516	323 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	ALDH3B2	P48448	385 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	MEOX2	P50222	304 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	IL18	Q14116	193 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	OR1S1	Q8NH92	325 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	RSG1	Q9BU20	258 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		8.83	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF98	A6NK75	572 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	LYRM9	A8MSI8	78 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	CTDSPL	O15194	276 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	PITX3	O75364	302 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	INS	P01308	110 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	DEFB130B	P0DP73	79 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	DEFB130A	P0DP74	79 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	GALR1	P47211	349 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	SPCS2	Q15005	226 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	FCN2	Q15485	313 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	BAP18	Q8IXM2	172 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	C6orf223	Q8N319	242 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		8.82	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	PRSS46	E5RG02	174 aa		8.81	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	NUDT3	O95989	172 aa		8.81	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	AZU1	P20160	251 aa		8.81	□□□□□ -1
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF182	Q8N6D2	247 aa		8.81	□□□□□ -1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms