RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 HBE1P02100 147 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 SERPINE2P07093 398 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 FXYD7P58549 80 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 SELENOTP62341 195 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 RANP62826 216 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ATP5G2Q06055 141 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 TM2D1Q9BX74 207 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 TMEM140Q9NV12 185 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 OR11H12B2RN74 326 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 K7EP13 123 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 IGHG4P01861 327 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 MC5RP33032 325 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 CCL20P78556 96 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 PRSS8Q16651 343 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 DEFB135Q30KP9 77 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 J3KRW8 73 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ARL3P36405 182 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 SSX7Q7RTT5 188 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 NAGKQ9UJ70 344 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 CGB1A6NKQ9 187 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 OR9G9P0C7N8 305 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 PIGPP57054 158 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 TAS2R46P59540 309 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 Q8N6K4 173 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 Q8NFD4 153 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 OR52M1Q8NGK5 317 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GV50 99 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 HPRT1P00492 218 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 PRM2P04554 102 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ERVK-16P61578 105 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 TBC1D26Q86UD7 250 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 IGLV2-23P01705 113 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ELANEP08246 267 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 CEBPGP53567 150 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 OR5I1Q13606 314 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ZNF266Q14584 549 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 LINC00596Q86U02 117 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 OR4A16Q8NH70 328 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 MOB3AQ96BX8 217 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 IMMP2LQ96T52 175 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 RAB9BQ9NP90 201 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 H3BTX0 84 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 PITX3O75364 302 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 SCGB1D1O95968 90 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 SCGB1D2O95969 90 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 IGLV2-14P01704 120 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 HLA-DRB1P01911 266 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 PPBPP02775 128 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 IAPPP10997 89 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ATP6V0CP27449 155 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 VAMP2P63027 116 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-212ENST00000548567 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms