RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	ZFP92	A6NM28	416 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777		P0DMU3	169 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	FXYD7	P58549	80 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	DEFB1	P60022	68 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	NUDT15	Q9NV35	164 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0B4J2A0	478 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SFT2D2	O95562	160 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	VAMP1	P23763	118 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ID1	P41134	155 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF90	Q03938	601 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	GAMT	Q14353	236 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	C9orf170	A2RU37	121 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	EMP1	P54849	157 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SLC35E1	Q96K37	410 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	OR4E1	P0C645	316 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ANXA3	P12429	323 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PSMB3	P49720	205 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	LYZ	P61626	148 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	OR1S1	Q8NH92	325 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	COQ8A	Q8NI60	647 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	RFNG	Q9Y644	331 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777		M0R2N4	97 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	FABP1	P07148	127 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SRPX	P78539	464 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	OR2F1	Q13607	317 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ENKUR	Q8TC29	256 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1B0GVY2	172 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SOCS3	O14543	225 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ADAP1	O75689	374 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TRGV9	Q99603	122 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.46	□□□□□ -0.57
DDX11-222	ENST00000542777	DNAH2	Q9P225	4427 aa		11.46	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	IAPP	P10997	89 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	RAB11A	P62491	216 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PSG9	Q00887	426 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	LRTM2	Q8N967	370 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777		F6UB75	175 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	ISLR	O14498	428 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	RTL8C	O15255	209 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PITX3	O75364	302 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	IFNA21	P01568	189 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	HOXB5	P09067	269 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PAX9	P55771	341 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	DEFA1	P59665	94 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	DEFA3	P59666	94 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDX11-222	ENST00000542777	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.44	□□□□□ -0.58

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