RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 COX19Q49B96 90 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 IGKV1-16P04430 117 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ADH4P08319 380 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 PRDX2P32119 198 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 DLX1P56177 255 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SSX8Q7RTT4 187 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 CORO2AQ92828 525 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ENY2Q9NPA8 101 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 DSCAMO60469 2012 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PPR1 153 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 C8orf88P0DMB2 117 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ADIPOQQ15848 244 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 CSTL1Q9H114 145 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ABCA1O95477 2261 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.35□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 A0A1B0GXF2 115 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PRE2 83 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 GAGE12BA1L429 117 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 PSMB11A5LHX3 300 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 E7EQL1 145 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 H3BTX0 84 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 CIDEAO60543 219 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 OR2J3O76001 311 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 ZNF329Q86UD4 541 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 TEX45Q8NA69 505 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 J3QR06 171 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 PEX7O00628 323 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 OR4S2Q8NH73 311 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 GTSF1Q8WW33 167 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 CCL17Q92583 94 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 NOTCH2Q04721 2471 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-211ENST00000541990 E7EUB6 86 aa7.34□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 LEPROTL1O95214 131 aa7.34□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 IGHV1-46P01743 117 aa7.34□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.34□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.34□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 JMJD8Q96S16 334 aa7.34□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 ST20Q9HBF5 79 aa7.34□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 JKAMPQ9P055 326 aa7.34□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 JPT1Q9UK76 154 aa7.34□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 NDUFS7O75251 213 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CSN3P07498 182 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 GLRXP35754 106 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CALYQ9NYX4 217 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 SHISA9B4DS77 424 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PPIAL4DF5H284 164 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 NCR2O95944 276 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TAS2R45P59539 299 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PATE2Q6UY27 113 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 ASCL2Q99929 193 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 A1L4Q6 167 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 BLNKQ8WV28 456 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 DYSFO75923 2080 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FBN2P35556 2912 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TMEM238C9JI98 176 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PRCDQ00LT1 54 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 PAXXQ9BUH6 204 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 GOSR1O95249 250 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 MOSP00540 346 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 HBBP68871 147 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 RASL11AQ6T310 242 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-211ENST00000541990 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.31□□□□□ -1.24
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