RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC35E1Q96K37 410 aa8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 C20orf173Q96LM9 149 aa8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 NEU1Q99519 415 aa8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SRRQ9GZT4 340 aa8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 A8MTW9 85 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 F6UB75 175 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 WRBO00258 174 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SYNGR2O43760 224 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 HOXB5P09067 269 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 VAMP1P23763 118 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 FXYD7P58549 80 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 AP3S2P59780 193 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 LYZP61626 148 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB11AP62491 216 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00052Q96N35 136 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.45□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 C9orf170A2RU37 121 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 ADAP1O75689 374 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV3-20P01619 116 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PSMB3P49720 205 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PAX9P55771 341 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF126Q9BV68 326 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.44□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0J9YX75 114 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF98A6NK75 572 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 ISLRO14498 428 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 MED6O75586 246 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 AMTNQ6UX39 209 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PKD1P98161 4303 aa8.43□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFB6O95139 128 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 FABP1P07148 127 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A5P33763 92 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 BTCP35070 178 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 ID1P41134 155 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PSG9Q00887 426 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM78BQ5VT40 261 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 RSG1Q9BU20 258 aa8.42□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BP45 60 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 CCNKO75909 580 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 AMBPP02760 352 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 DKK2Q9UBU2 259 aa8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PRM2P04554 102 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4E1P0C645 316 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 ORM2P19652 201 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PLP1P60201 277 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PATE2Q6UY27 113 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM8Q96KF7 97 aa8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 PKHD1P08F94 4074 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC160A6NGH7 325 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 EMP1P54849 157 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 ARL16Q0P5N6 197 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.39□□□□□ -1.07
CLSTN3-211ENST00000541667 COQ8AQ8NI60 647 aa8.39□□□□□ -1.07
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