RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	OR51M1	Q9H341	326 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	RNF24	Q9Y225	148 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	IL4	P05112	153 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	OR2C1	O95371	312 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	CLEC3B	P05452	202 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	CTSG	P08311	255 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM86B	Q8N661	226 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610		A0A0G2JLM5	398 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610		M0R036	132 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	OR10J4	P0C629	311 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	PF4V1	P10720	104 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	GPR183	P32249	361 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	TPPP2	P59282	170 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610		A0A1W2PRE2	83 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	SCO1	O75880	301 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	TVP23C	Q96ET8	276 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	GNB4	Q9HAV0	340 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF727	A8MUV8	499 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610		H3BQ15	152 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	ATP5G3	P48201	142 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610		Q6ZS46	218 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM89	A2RUT3	159 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	BMPR1B	O00238	502 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TGOLN2	O43493	480 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	SLC35B1	P78383	322 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	ATRAID	Q6UW56	229 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	RHEB	Q15382	184 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	FAM209B	Q5JX69	171 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	PYY	P10082	97 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	ADM	P35318	185 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM160	Q9NX00	188 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	NAT8	Q9UHE5	227 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	INAFM1	C9JVW0	142 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610		H3BRN7	92 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	RAB9A	P51151	201 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	PARL	Q9H300	379 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610		B4DEV8	164 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	NDUFB4	O95168	129 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	IGHG4	P01861	327 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	ARL3	P36405	182 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	CFHR3	Q02985	330 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	LEMD1	Q68G75	181 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF98	A6NK75	572 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-222	ENST00000534610	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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