RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531244.1

PPP6R3-222, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 5

Gene PPP6R3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-222	ENST00000531244	DPRX	A6NFQ7	191 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TSTD3	H0UI37	97 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TMEM250	H0YL14	139 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244		K7EQM0	130 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	NDUFA2	O43678	99 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SPINK4	O60575	86 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	FOXH1	O75593	365 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	MMP23A	O75900	390 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CNIH1	O95406	144 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	LHB	P01229	141 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	IGHV3-48	P01763	117 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RBP4	P02753	201 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	LYNX1	P0DP58	116 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	ORM2	P19652	201 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TCL1A	P56279	114 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	UBE2G1	P62253	170 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PRCD	Q00LT1	54 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RPEL1	Q2QD12	228 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TIGIT	Q495A1	244 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SSX8	Q7RTT4	187 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	BAGE3	Q86Y29	109 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	BAGE2	Q86Y30	109 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR1P1	Q8NH06	330 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR4X1	Q8NH49	305 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR52E5	Q8NH55	327 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR9G1	Q8NH87	305 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	LINC01560	Q8TB33	94 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	BLNK	Q8WV28	456 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RPE	Q96AT9	228 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TIMD4	Q96H15	378 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR8B2	Q96RD0	313 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RNF2	Q99496	336 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	NABP2	Q9BQ15	211 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PRO1933	Q9H354	126 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	MIOX	Q9UGB7	285 aa		2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244		A0A087WZ39	114 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HELT	A6NFD8	242 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244		E7EQL1	145 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244		H0YJW9	148 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	ITGB1BP1	O14713	200 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST1H2BK	O60814	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CDK2AP2	O75956	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	VENTX	O95231	258 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	MOS	P00540	346 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	IGKV1-16	P04430	117 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	LINC00869	P0C866	280 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244		P0C879	139 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CT45A6	P0DMU7	189 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CT45A5	P0DMU8	189 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CT45A7	P0DMV0	189 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SFTPC	P11686	197 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST1H2BO	P23527	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CRYBB3	P26998	211 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST1H2BB	P33778	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CFHR2	P36980	270 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	NBL1	P41271	181 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TDGF1P3	P51864	188 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RND2	P52198	227 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	UCN	P55089	124 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST1H2BD	P58876	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	LYZ	P61626	148 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST1H2BC	P62807	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	DEFA6	Q01524	100 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	FXYD3	Q14802	87 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CENPW	Q5EE01	88 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	UTF1	Q5T230	341 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HCP5	Q6MZN7	132 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		2.55	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms