RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 B2MP61769 119 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRU-209ENST00000526080 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRU-209ENST00000526080 SNX29P2Q8IUI4 249 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRU-209ENST00000526080 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRU-209ENST00000526080 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF503Q96F45 646 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRU-209ENST00000526080 COPZ2Q9P299 210 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRU-209ENST00000526080 CACNG5Q9UF02 275 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRU-209ENST00000526080 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRU-209ENST00000526080 MEOX2P50222 304 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRU-209ENST00000526080 BAP18Q8IXM2 172 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRU-209ENST00000526080 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRU-209ENST00000526080 OR13C8Q8NGS7 320 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRU-209ENST00000526080 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRU-209ENST00000526080 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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PTPRU-209ENST00000526080 LINC00315P59091 139 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRU-209ENST00000526080 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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PTPRU-209ENST00000526080 C16orf92Q96LL3 132 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRU-209ENST00000526080 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.51□□□□□ -0.89
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PTPRU-209ENST00000526080 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRU-209ENST00000526080 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRU-209ENST00000526080 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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PTPRU-209ENST00000526080 ZNF98A6NK75 572 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 FABP1P07148 127 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 OR5I1Q13606 314 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-209ENST00000526080 RNF182Q8N6D2 247 aa9.46□□□□□ -0.9
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