RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa12.09□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 TMEM189A5PLL7 270 aa12.09□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 F6UB75 175 aa12.09□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 RAB11AP62491 216 aa12.09□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 ZNF79Q15937 498 aa12.09□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 LINC00336Q6ZUF6 198 aa12.09□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 OR8I2Q8N0Y5 310 aa12.09□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 CLUHP3Q96NS8 147 aa12.09□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 RFNGQ9Y644 331 aa12.09□□□□□ -0.47
HERC3-211ENST00000513325 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa12.08□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa12.08□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 M0R2N4 97 aa12.08□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 ISLRO14498 428 aa12.08□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 PSG9Q00887 426 aa12.08□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 TMEM128Q5BJH2 165 aa12.08□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 FAM78BQ5VT40 261 aa12.08□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.08□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa12.08□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 H3BMQ9 156 aa12.07□□□□□ -0.48
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HERC3-211ENST00000513325 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa12.07□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 EBLN2Q6P2I7 272 aa12.07□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 THAP8Q8NA92 274 aa12.07□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 MCFD2Q8NI22 146 aa12.07□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 DKK2Q9UBU2 259 aa12.07□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 A0A0J9YX75 114 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GVY2 172 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 NOL3O60936 208 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A6P12236 298 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 LRTM2Q8N967 370 aa12.06□□□□□ -0.48
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HERC3-211ENST00000513325 C20orf173Q96LM9 149 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 MAGT1Q9H0U3 335 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A32Q9H2D1 315 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A22Q9H936 323 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 WRBO00258 174 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 MED6O75586 246 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 PYDC2Q56P42 97 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 GGNBP1Q5YKI7 109 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 TOMM5Q8N4H5 51 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 C16orf92Q96LL3 132 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 C17orf77Q96MU5 243 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 RSG1Q9BU20 258 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 RPRMQ9NS64 109 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 TMED3Q9Y3Q3 217 aa12.05□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 ZNF98A6NK75 572 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 PRSS46E5RG02 174 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 RTL8CO15255 209 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 SYNGR2O43760 224 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 CFDP00746 253 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 HBE1P02100 147 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
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HERC3-211ENST00000513325 MEOX2P50222 304 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 AP3S2P59780 193 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 RPP30P78346 268 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 SAMD13Q5VXD3 122 aa12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1109Q2LD37 5005 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 PRSS29PA6NIE9 313 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 SFT2D2O95562 160 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 IFNA21P01568 189 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 HOXB5P09067 269 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 HTN3P15516 51 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 ORM2P19652 201 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R1AQ13522 171 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-211ENST00000513325 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa12.03□□□□□ -0.48
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HERC3-211ENST00000513325 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
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HERC3-211ENST00000513325 OXA1LQ15070 435 aa12.02□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 RRN3P1Q2M238 152 aa12.02□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 LGALS9BQ3B8N2 356 aa12.02□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 SPANXN5Q5MJ07 72 aa12.02□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 AMTNQ6UX39 209 aa12.02□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa12.02□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 BPIFCQ8NFQ6 507 aa12.02□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 FAT2Q9NYQ8 4349 aa12.02□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 DNAH2Q9P225 4427 aa12.02□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.01□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 H3BP45 60 aa12.01□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 AKR1C1Q04828 323 aa12.01□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 IGFL4Q6B9Z1 124 aa12.01□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 OR4D5Q8NGN0 318 aa12.01□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 OR1B1Q8NGR6 318 aa12.01□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa12.01□□□□□ -0.49
HERC3-211ENST00000513325 TMEM208Q9BTX3 173 aa12.01□□□□□ -0.49
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