RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	NUP35	Q8NFH5	326 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SFTPC	P11686	197 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	PDLIM4	P50479	330 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF138	P52744	262 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ADIPOQ	Q15848	244 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF114	Q8NC26	417 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	NEUROG1	Q92886	237 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0G2JNJ9	132 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TCRA	P04437	139 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	RHOG	P84095	191 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	KLRD1	Q13241	179 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ASCL2	Q99929	193 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		Q9UFV3	132 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		A6NJY4	79 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF124	Q15973	351 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	GLMP	Q8WWB7	406 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	DKK1	O94907	266 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	CACNG7	P62955	275 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	DTX1	Q86Y01	620 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF56	Q15929	161 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	KIR2DL4	Q99706	377 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GW15	77 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF134	P52741	427 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	FBLN7	Q53RD9	439 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZS92	163 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	RNF138	Q8WVD3	245 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	CEP350	Q5VT06	3117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GWJ7	208 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM13	P0DJ93	91 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	EVI2A	P22794	236 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	LEP	P41159	167 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	FXYD7	P58549	80 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SYT8	Q8NBV8	401 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	DDB2	Q92466	427 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	RAX	Q9Y2V3	346 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPI3	338 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		H3BUT2	72 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	EREG	O14944	169 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	MMP23A	O75900	390 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ATP5L	O75964	103 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	NCR2	O95944	276 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		Q8NFD4	153 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TNFRSF14	Q92956	283 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TECTA	O75443	2155 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV2-70	P01814	119 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TRGV9	Q99603	122 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	PLXNB1	O43157	2135 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	hDV102S1	A0JD36	115 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		A8MWP6	167 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	HBD	P02042	147 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	TSPO	P30536	169 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ASIP	P42127	132 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193		Q8TAT8	98 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFA3	O95167	84 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	C15orf65	H3BRN8	121 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	THBD	P07204	575 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	COL8A2	P25067	703 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NEK1-208	ENST00000512193	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36

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