RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 OR2D2Q9H210 308 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 OR52D1Q9H346 318 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 ACOT13Q9NPJ3 140 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 ANXA10Q9UJ72 324 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 PRNDQ9UKY0 176 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1W2PP18 115 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 C9JAW5 83 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 H0YGG7 62 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 TNFSF13O75888 250 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 GABARAPO95166 117 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 CDRT1O95170 752 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 SOX14O95416 240 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 C1orf105O95561 183 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 LSM8O95777 96 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 AIFM1O95831 613 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 OXTP01178 125 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 CD8AP01732 235 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 HBE1P02100 147 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 HLA-DQB2P05538 268 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 TACSTD2P09758 323 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 H2BFMP0C1H6 154 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 FABP4P15090 132 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 NTF3P20783 257 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 SRIP30626 198 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 OR10J1P30954 320 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 G6PCP35575 357 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 SSR4P51571 173 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 MYL5Q02045 173 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 PNOCQ13519 176 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 EBI3Q14213 229 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 GGTLC2Q14390 218 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 HMGN3Q15651 99 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 OR10K2Q6IF99 312 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 CMC1Q7Z7K0 106 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF740Q8NDX6 193 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 C10orf105Q8TEF2 133 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 PP6455Q8WZ26 134 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 TSLPQ969D9 159 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 UBE2E3Q969T4 207 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM106AQ96A25 262 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 TSPAN32Q96QS1 320 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 CLCC1Q96S66 551 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 MCHR1Q99705 422 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 THTPAQ9BU02 230 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 SAMD10Q9BYL1 202 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 RBKSQ9H477 322 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 VSIRQ9H7M9 311 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF586Q9NXT0 402 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 HIGD1AQ9Y241 93 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 CYSLTR1Q9Y271 337 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 ASF1AQ9Y294 204 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 TENM3Q9P273 2699 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 A0A0D9SG52 128 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1B0GWB2 263 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 H7BYZ3 331 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 H7C1C5 153 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 RPS10P46783 165 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 LHX2P50458 406 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 SLC18A1P54219 525 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 DLX1P56177 255 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 OR12D2P58182 307 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 LINC00315P59091 139 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 TIGITQ495A1 244 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 DNAJC24Q6P3W2 148 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 C20orf196Q8IYI0 205 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 APCDD1LQ8NCL9 501 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 OR4K17Q8NGC6 315 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 OR51A2Q8NGJ7 313 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 OR2T27Q8NH04 317 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 FNDC9Q8TBE3 224 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 BORCS7Q96B45 105 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 PPCDCQ96CD2 204 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 STARD4Q96DR4 205 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 OR4K3Q96R72 315 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 PEBP4Q96S96 227 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-220ENST00000512069 OR2H1Q9GZK4 316 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms