RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTL10Q5JWF8 245 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 STHQ8IWL8 128 aa13.69□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 RAB40CQ96S21 281 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf1Q9H5F2 150 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 DOK5Q9P104 306 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 HYDINQ4G0P3 5121 aa13.69□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf51A6NDU8 294 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 SOCS3O14543 225 aa13.68□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM144Q7Z5S9 345 aa13.68□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A32Q9H2D1 315 aa13.68□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa13.67□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R30P59541 319 aa13.66□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.66□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 IL17DQ8TAD2 202 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A22Q9H936 323 aa13.66□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 PMS2P11Q13670 270 aa13.65□□□□□ -0.22
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SH3BP2-218ENST00000511185 H3BRN7 92 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 IL15RAQ13261 267 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB32Q13637 225 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf194Q5T5A4 169 aa13.64□□□□□ -0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 MGAT4CQ9UBM8 478 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAH1Q9P2D7 4330 aa13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 CAV2P51636 162 aa13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR11H2Q8NH07 326 aa13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 RARRES2Q99969 163 aa13.63□□□□□ -0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL17Q9UF56 701 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 IGSF23A1L1A6 192 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 FNDC10F2Z333 226 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 GOSR2O14653 212 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CFDP00746 253 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 BCAP31P51572 246 aa13.62□□□□□ -0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC45A2Q9UMX9 530 aa13.62□□□□□ -0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 PSMB3P49720 205 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 TEPPQ6URK8 271 aa13.61□□□□□ -0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00052Q96N35 136 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 PFDN2Q9UHV9 154 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 AGPAT2O15120 278 aa13.6□□□□□ -0.23
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SH3BP2-218ENST00000511185 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 PATE2Q6UY27 113 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 HIGD1AQ9Y241 93 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CXorf65A6NEN9 183 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV3-20P01619 116 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5G3P0C626 314 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8NAQ8 132 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 RSG1Q9BU20 258 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL6Q9H0F7 186 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
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