RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 OR7C2O60412 319 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 CDS2O95674 445 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 OR2H2O95918 312 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 GYPCP04921 128 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 SOD3P08294 240 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 UCHL1P09936 223 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TLX1NBP0CAT3 122 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 ESDP10768 282 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 PTHLHP12272 177 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 RBMXP38159 391 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 PLCXD2Q0VAA5 305 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 IL15RAQ13261 267 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 CLLU1Q5K131 121 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 FAM201AQ5SY85 155 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF773Q6PK81 442 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZRU5 148 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 CLEC20AQ6ZU45 233 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 C10orf126Q8N4M7 172 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 OR5W2Q8NH69 310 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 SLAMF6Q96DU3 332 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 DERL3Q96Q80 235 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 IMUPQ9GZP8 106 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM191AQ9H0A3 160 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 CST9LQ9H4G1 147 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 NF1P21359 2839 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TRIP11Q15643 1979 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 KNTC1P50748 2209 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PP18 115 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM218A2RU14 115 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 A6NDX4 124 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 ARRDC5A6NEK1 342 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 OR51F1A6NGY5 319 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 FABP5P3A8MUU1 101 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 C1orf196B1AJZ1 125 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 GADD45AP24522 165 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 MP68P56378 58 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 BTN1A1Q13410 526 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF684Q5T5D7 378 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 Q5W150 140 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 Q6Q795 121 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 WDR86Q86TI4 376 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 SAXO1Q8IYX7 474 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM256Q8N2U0 113 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 ZDHHC22Q8N966 263 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 Q8N9W7 124 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM229BQ8NBD8 167 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 SLC25A46Q96AG3 418 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TSPAN32Q96QS1 320 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 LYSMD1Q96S90 227 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 NDFIP1Q9BT67 221 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 SS18L2Q9UHA2 77 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 MPC1Q9Y5U8 109 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 NCKAP5O14513 1909 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 LRBAP50851 2863 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 MYLKQ15746 1914 aa1.49□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 G3V3Q6 166 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 C19orf84I3L1E1 186 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TNFP01375 233 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 GPX1P07203 203 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 BCL2P10415 239 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 PPIBP23284 216 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 KDELR1P24390 212 aa1.48□□□□□ -2.17
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PDE4D-218ENST00000509368 OPRM1P35372 400 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF83P51522 516 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 FABP5Q01469 135 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 C1DQ13901 141 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 MMDQ15546 238 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF181Q2M3W8 571 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 AMTNQ6UX39 209 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF720Q7Z2F6 126 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 MMGT1Q8N4V1 131 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 C3orf22Q8N5N4 141 aa1.48□□□□□ -2.17
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PDE4D-218ENST00000509368 GNB1LQ9BYB4 327 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 OR8D2Q9GZM6 311 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 POPDC3Q9HBV1 291 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 KCNIP2Q9NS61 270 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 TAS2R8Q9NYW2 309 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC167Q9P0B6 97 aa1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
PDE4D-218ENST00000509368 SLC23A2Q9UGH3 650 aa1.48□□□□□ -2.17
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