RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 ORM2P19652 201 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 OR8I2Q8N0Y5 310 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM24BQ8N5W8 94 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM147Q9BVK8 224 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 FNDC10F2Z333 226 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAF2O60831 178 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ID1P41134 155 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 SELENOTP62341 195 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 GGACTQ9BVM4 153 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC45A2Q9UMX9 530 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 K7EPK0 472 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CAV2P51636 162 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 S100A10P60903 97 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMG4Q5JS54 123 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CASC10Q5T4H9 136 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 NRARPQ7Z6K4 114 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 OR1B1Q8NGR6 318 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF183Q96D59 192 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 PMS2P5A8MQ11 134 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 RAP2BP61225 183 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 SAMD13Q5VXD3 122 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 TEPPQ6URK8 271 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 DEDDO75618 318 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CA1P00915 261 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 GALR1P47211 349 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 IFITM3Q01628 133 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ACTL10Q5JWF8 245 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 GATAD1Q8WUU5 269 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC25A22Q9H936 323 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF24Q9Y225 148 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 HYPMO75409 117 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 CCNKO75909 580 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 RLN2P04090 185 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB31Q13636 194 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM217Q8N7C4 229 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR82Q96P67 336 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF98A6NK75 572 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 GOSR2O14653 212 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SPP1P10451 314 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 MEOX2P50222 304 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00052Q96N35 136 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 HIGD1AQ9Y241 93 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 KNCNA6PVL3 124 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 OR5G3P0C626 314 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00869P0C866 280 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CYCSP99999 105 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF546Q86UE3 836 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 STX12Q86Y82 276 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 RARRES2Q99969 163 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 MARVELD1Q9BSK0 173 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMB3P49720 205 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 HBG1P69891 147 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 HBG2P69892 147 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC38A11Q08AI6 406 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB32Q13637 225 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 DOK5Q9P104 306 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SSNA1O43805 119 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 CST7O76096 145 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 S100A11P31949 105 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 C16orf92Q96LL3 132 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 RSG1Q9BU20 258 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ARL6Q9H0F7 186 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0J9YWU9 116 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ISLRO14498 428 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SULT1A1P50225 295 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ARL16Q0P5N6 197 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 OR11H2Q8NH07 326 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 NMES1Q9C002 83 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 AGPAT2O15120 278 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 RPL7P18124 248 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 PLP1P60201 277 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 IL15RAQ13261 267 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC25A32Q9H2D1 315 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-210ENST00000505941 SIX6O95475 246 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP6V1FQ16864 119 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 EBLN2Q6P2I7 272 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 Q6ZRG5 221 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM252Q8N6L7 170 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC25A31Q9H0C2 315 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 E5RGE8 158 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-210ENST00000505941 CAMLGP49069 296 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms