RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 C9orf62Q8N4C0 152 aa13.39□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.39□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.39□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 STOML3Q8TAV4 291 aa13.39□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 GATAD1Q8WUU5 269 aa13.39□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 HIGD1AQ9Y241 93 aa13.39□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 SEC14L6B5MCN3 397 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 C1orf194Q5T5A4 169 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 MIC13Q5XKP0 118 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC51BQ86UW2 128 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 OR1B1Q8NGR6 318 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 DYNLRB2Q8TF09 96 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF414Q96IQ9 312 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 GPR82Q96P67 336 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 ARV1Q9H2C2 271 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.38□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 ANK2Q01484 3957 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 SAP30O75446 220 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 OR5G3P0C626 314 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 FOLR2P14207 255 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 ORM2P19652 201 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 CBLN1P23435 193 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 ATP6V0CP27449 155 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 TM4SF20Q53R12 229 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 RSG1Q9BU20 258 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 SMPXQ9UHP9 88 aa13.37□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 CSN3P07498 182 aa13.36□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 C10orf113Q5VZT2 155 aa13.36□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa13.36□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 BAP18Q8IXM2 172 aa13.36□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 VSIRQ9H7M9 311 aa13.36□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 U3KQE9 123 aa13.36□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.35□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 WIPF1O43516 503 aa13.35□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 SEC11BP0C7V7 166 aa13.35□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 M6PRP20645 277 aa13.35□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.35□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa13.35□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 WNK1Q9H4A3 2382 aa13.34□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 HELTA6NFD8 242 aa13.34□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 H3BRN7 92 aa13.34□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 CHEK1O14757 476 aa13.34□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 SPP1P10451 314 aa13.34□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 IL34Q6ZMJ4 242 aa13.34□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa13.34□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CTDSP1-215ENST00000498160 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 UMAD1C9J7I0 102 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 BUB3O43684 328 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 MEOX2P50222 304 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 RHOBP62745 196 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 LCN12Q6JVE5 192 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 LINC00305Q7Z4B0 112 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC25A32Q9H2D1 315 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 DOK5Q9P104 306 aa13.33□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF98A6NK75 572 aa13.32□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 IGLV1-51P01701 117 aa13.32□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 TAS2R45P59539 299 aa13.32□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 C16orf54Q6UWD8 224 aa13.32□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 STXBP6Q8NFX7 210 aa13.32□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.32□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1W2PPV4 95 aa13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 GALR1P47211 349 aa13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 PAFAH1B2P68402 229 aa13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 DEFB114Q30KQ6 69 aa13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM41BQ5BJD5 291 aa13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 PATE2Q6UY27 113 aa13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 OR8I2Q8N0Y5 310 aa13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM37Q8WXS4 190 aa13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 ST8SIA2Q92186 375 aa13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 FUT9Q9Y231 359 aa13.31□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 RAB5CP51148 216 aa13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 FAM78BQ5VT40 261 aa13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 OR10G4Q8NGN3 311 aa13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 OR10G9Q8NGN4 311 aa13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 OR10G7Q8NGN6 311 aa13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 GLMPQ8WWB7 406 aa13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 MLXQ9UH92 298 aa13.3□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 TSPAN4O14817 238 aa13.29□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 IGLL1P15814 213 aa13.29□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 KHDC3LQ587J8 217 aa13.29□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa13.29□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.29□□□□□ -0.28
CTDSP1-215ENST00000498160 TCF24Q7RTU0 167 aa13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms