RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CLN5	O75503	358 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	DFFB	O76075	338 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFA7	O95182	113 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	C4BPB	P20851	252 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	HBG1	P69891	147 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	HBG2	P69892	147 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	HES1	Q14469	280 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	STX12	Q86Y82	276 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.39	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717		H3BUA1	57 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CORT	O00230	105 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OPN1MW	P04001	364 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	REG1A	P05451	166 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	NMB	P08949	121 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SULT1A2	P50226	295 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	BLCAP	P62952	87 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF266	Q14584	549 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	STH	Q8IWL8	128 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	MGST2	Q99735	147 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.38	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717		G3V318	75 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	MPDU1	O75352	247 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	YIF1A	O95070	293 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	TOMM40	O96008	361 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	IFNA10	P01566	189 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHG4	P01861	327 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00869	P0C866	280 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	PSMB8	P28062	276 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB11A	P62491	216 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SERF2	P84101	59 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CLINT1	Q14677	625 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	PLGLA	Q15195	96 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	LY6E	Q16553	131 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.37	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	MT-CO2	P00403	227 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	IFNA7	P01567	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	SLPI	P03973	132 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
DCTN1-222	ENST00000492717	OPRK1	P41145	380 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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