RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 COQ8AQ8NI60 647 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 SOSTQ9BQB4 213 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 MCUBQ9NWR8 336 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 DKK2Q9UBU2 259 aa11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 ISLRO14498 428 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 RTL8CO15255 209 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB11AP62491 216 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 PSG9Q00887 426 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 OXA1LQ15070 435 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 THAP8Q8NA92 274 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 PKD1P98161 4303 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 MUC4Q99102 2169 aa11.82□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC25A6P12236 298 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 TMBIM6P55061 237 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 OR2F1Q13607 317 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM222AQ5U5X8 452 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM78BQ5VT40 261 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC35B3Q9H1N7 401 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa11.81□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A0J9YX75 114 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 M0R2N4 97 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 IFNA21P01568 189 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 MEOX2P50222 304 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 LRTM2Q8N967 370 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 RPRMQ9NS64 109 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 NACAE9PAV3 2078 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 FABP12A6NFH5 140 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 A8MTW9 85 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 F6UB75 175 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 MED6O75586 246 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 HBE1P02100 147 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 MED14OSP0DP75 135 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 IAPPP10997 89 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 TNFSF8P32971 234 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 FAUP35544 74 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 C16orf92Q96LL3 132 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 GALR1P47211 349 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 RRN3P1Q2M238 152 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF212Q495C1 297 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 GSG1LQ6UXU4 331 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 Q6ZR54 194 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 C20orf173Q96LM9 149 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 DOK5Q9P104 306 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF98A6NK75 572 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 PRSS46E5RG02 174 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 OR4D5Q8NGN0 318 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 C17orf77Q96MU5 243 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC25A32Q9H2D1 315 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 AMTNQ6UX39 209 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 TRIM63Q969Q1 353 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 RSG1Q9BU20 258 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC25A22Q9H936 323 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 PCLOQ9Y6V0 5065 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 SYNGR2O43760 224 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 VAMP1P23763 118 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 S100A7P31151 101 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 AP3S2P59780 193 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 OR1B1Q8NGR6 318 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR82Q96P67 336 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 H3BMQ9 156 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 WRBO00258 174 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 SFT2D2O95562 160 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 HTN3P15516 51 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-210ENST00000489601 ORM2P19652 201 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms