RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.76□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.76□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.76□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 hDV102S1A0JD36 115 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 PPIAL4DF5H284 164 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 CHEK1O14757 476 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 FAM87AP0C7U9 286 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 MPV17L2Q567V2 206 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 LINC01545Q5VT33 79 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 CD24P25063 80 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 CCL8P80075 99 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 PIP4P1Q86T03 277 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 RITA1Q96K30 269 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.75□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 M0R296 226 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 FAM27E3Q08E93 113 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 ADIPOQQ15848 244 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 HCP5Q6MZN7 132 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 A0A1B0GW15 77 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 NDUFB3O43676 98 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 COL8A1P27658 744 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 NBL1P41271 181 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 NUDT3O95989 172 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 TNFRSF14Q92956 283 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 CADP27708 2225 aa8.74□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 ZNF785A8K8V0 405 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 IGLC1P0CG04 106 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 PRR31Q5SQ13 230 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 CTSZQ9UBR2 303 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 TEX22C9J3V5 150 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 CD5LO43866 347 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 PPBPP02775 128 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 RBPJQ06330 500 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 VAMP3Q15836 100 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 DPF1Q92782 380 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 A0A1B0GUT8 65 aa8.72□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 RIGQ13278 110 aa8.72□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 Q6ZS92 163 aa8.72□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.72□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 COX8AP10176 69 aa8.72□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 PSG1P11464 419 aa8.72□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 Q6AWC8 147 aa8.72□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.72□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 H3BTX0 84 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 HTR1DP28221 377 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 MUC21Q5SSG8 566 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 ZNF747Q9BV97 191 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 RNF24Q9Y225 148 aa8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
NEB-215ENST00000489048 I3L2K1 104 aa8.71□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.71□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 PRNTQ86SH4 94 aa8.71□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.71□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 ZNF138P52744 262 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 LYZP61626 148 aa8.7□□□□□ -1.02
NEB-215ENST00000489048 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms