RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.8□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 RFX7Q2KHR2 1363 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIK3R4Q99570 1358 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIF15Q9NS87 1388 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TANC2Q9HCD6 1990 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGEF5Q12774 1597 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 DAPL1A0PJW8 107 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC160A6NGH7 325 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACOX3O15254 700 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2B3O76000 313 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCL1BO95988 128 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNAL4O96015 105 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRM2P04554 102 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL6P05231 212 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 FREM3P0C091 2139 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM228BP0C875 321 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL2P13500 99 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL20P78556 96 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMAGPQ0VAQ4 97 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM45BPQ6NSW5 357 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBL4BQ8N7F7 174 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC37A2Q8TED4 501 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPH3Q96FX2 82 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 MED29Q9NX70 200 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 U3KQA8 63 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 BCORL1Q5H9F3 1711 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 EEA1Q15075 1411 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-0.81□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A0D9SG52 128 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB19A4D1S5 217 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TLCD2A6NGC4 264 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4C45A6NMZ5 311 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 DISC1C4P0D8 188 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 C5orf67F2Z3F1 127 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SULT1C2O00338 296 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 STX10O60499 249 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL1P22362 96 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM74A1Q5RGS3 127 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRR15Q8IV56 129 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 LYSMD1Q96S90 227 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIMD2Q9BT23 127 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRRG3Q9BZD7 231 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ULBP3Q9BZM4 244 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ITSN1Q15811 1721 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNS3Q68CZ2 1445 aa-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 NFAT5O94916 1531 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TGOLN2O43493 480 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 BRI3O95415 125 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 REG1AP05451 166 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXCR4P61073 352 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 RHEBQ15382 184 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYCP1Q15431 976 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 HLA-DRB5Q30154 266 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB113Q30KQ7 82 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM78BQ5VT40 261 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5L1Q8NGL2 311 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSMF1Q92530 271 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBP7Q96R05 134 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 BCL7BQ9BQE9 202 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 EFCAB1Q9HAE3 211 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFSF18Q9UNG2 199 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC37A3O60309 1634 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 BCORQ6W2J9 1755 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 DIP2AQ14689 1571 aa-0.83□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYOM1P52179 1685 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIP14410 1827 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIF13BQ9NQT8 1826 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA0556O60303 1618 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCRL2O00421 344 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SULT1B1O43704 296 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms