RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP92A6NM28 416 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 F6UB75 175 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 HBE1P02100 147 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 LYZP61626 148 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 PSG9Q00887 426 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GAMTQ14353 236 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 OXA1LQ15070 435 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 CTF1Q16619 201 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM78BQ5VT40 261 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 LGI3Q8N145 548 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 DTD1Q8TEA8 209 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 IL22RA2Q969J5 263 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 RBKSQ9H477 322 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR132Q9UNW8 380 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 U3KQ87 197 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0J9YX75 114 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 DISC1C4P0D8 188 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 ISLRO14498 428 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 PAX9P55771 341 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2F1Q13607 317 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 C6orf223Q8N319 242 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35E1Q96K37 410 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 C20orf173Q96LM9 149 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0B4J2A0 478 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 A8MTW9 85 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 AKAIN1P0CW23 69 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 CCR6P51684 374 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 DAD1P61803 113 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SMCO1Q147U7 214 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 RRN3P1Q2M238 152 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 AMTNQ6UX39 209 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 C17orf77Q96MU5 243 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 PRRT1Q99946 306 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 DOK5Q9P104 306 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 MDFICQ9P1T7 246 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.63□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 NACAE9PAV3 2078 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 CTDSP2O14595 271 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 RGS5O15539 181 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 PRM2P04554 102 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 FABP1P07148 127 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 FRZBQ92765 325 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 C16orf92Q96LL3 132 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 TRGV9Q99603 122 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 RPRMQ9NS64 109 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM18P0DKX4 95 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 AKR1C4P17516 323 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 GALR1P47211 349 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 ALDH3B2P48448 385 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 MEOX2P50222 304 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 XGP55808 180 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 THAP8Q8NA92 274 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1S1Q8NH92 325 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 ATG101Q9BSB4 218 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 RSG1Q9BU20 258 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 LYRM9A8MSI8 78 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 M0R2Z0 102 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 CTDSPLO15194 276 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 PITX3O75364 302 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 INSP01308 110 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB130BP0DP73 79 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB130AP0DP74 79 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 IAPPP10997 89 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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