RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 BCAP31P51572 246 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 CAV2P51636 162 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 LEMD1Q68G75 181 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 OVOL2Q9BRP0 275 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 NRN1Q9NPD7 142 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 MGAT4CQ9UBM8 478 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 SLC45A2Q9UMX9 530 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 ZNF688P0C7X2 276 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 C1orf194Q5T5A4 169 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 UBE2CO00762 179 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 CST7O76096 145 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 ORM2P19652 201 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 TEPPQ6URK8 271 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R14BQ96C90 147 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 NMES1Q9C002 83 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 IGSF23A1L1A6 192 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 SELENOTP62341 195 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A11Q08AI6 406 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZWC4 215 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 TMEM252Q8N6L7 170 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 OR1B1Q8NGR6 318 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 FBXL17Q9UF56 701 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 ZNF98A6NK75 572 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 H2BFSP57053 126 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 PLP1P60201 277 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 OR8I2Q8N0Y5 310 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 TMEM217Q8N7C4 229 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 TMEM147Q9BVK8 224 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 CSTL1Q9H114 145 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 DOK5Q9P104 306 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 SSNA1O43805 119 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 LINC00869P0C866 280 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 SULT1A1P50225 295 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 CYCSP99999 105 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 DEFB135Q30KP9 77 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 PSMG4Q5JS54 123 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 MUC7Q8TAX7 377 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 DNAH7Q8WXX0 4024 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-211ENST00000480301 KNCNA6PVL3 124 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 H0YIZ8 118 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 C3orf84H3BNL1 204 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 AGPAT2O15120 278 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 SPRY2O43597 315 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 RNF183Q96D59 192 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 C17orf77Q96MU5 243 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 MGST2Q99735 147 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A32Q9H2D1 315 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 SOCS3O14543 225 aa15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 HYPMO75409 117 aa15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 PTTG1O95997 202 aa15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 S100A11P31949 105 aa15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 VWC2Q2TAL6 325 aa15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 PATE2Q6UY27 113 aa15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 STHQ8IWL8 128 aa15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A22Q9H936 323 aa15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 HIGD1AQ9Y241 93 aa15.38■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 H3BRN7 92 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 RLN2P04090 185 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 S100A7P31151 101 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 ZNF546Q86UE3 836 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 STX12Q86Y82 276 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 SCRT1Q9BWW7 348 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 AGRNO00468 2067 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 E5RGE8 158 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 OR5G3P0C626 314 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 RAP2BP61225 183 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 ACTL10Q5JWF8 245 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 ARL6Q9H0F7 186 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 WDR83OSQ9Y284 106 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 ALG5Q9Y673 324 aa15.36■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 GALR1P47211 349 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 HBG1P69891 147 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 HBG2P69892 147 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 NHLH2Q02577 135 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 GPR82Q96P67 336 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 UHRF2Q96PU4 802 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 RSG1Q9BU20 258 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 RNF126Q9BV68 326 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 ARV1Q9H2C2 271 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 ID1P41134 155 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 CAMLGP49069 296 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1FQ16864 119 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-211ENST00000480301 CA1P00915 261 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
ACTB-211ENST00000480301 LYL1P12980 280 aa15.33■□□□□ 0.04
ACTB-211ENST00000480301 PSMB3P49720 205 aa15.33■□□□□ 0.04
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