RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478693.1

SRRT-211, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-211ENST00000478693 VWC2Q2TAL6 325 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 ARL6Q9H0F7 186 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 SLC25A22Q9H936 323 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 HELTA6NFD8 242 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 MPDU1O75352 247 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 HYPMO75409 117 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 CD7P09564 240 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 B2MP61769 119 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 Q6ZRG5 221 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 STPG3Q8N7X2 389 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 ZNF709Q8N972 641 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 TUBA4BQ9H853 241 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 FBXL17Q9UF56 701 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 OPCMLQ14982 345 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 Q5BKY6 102 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 MIC13Q5XKP0 118 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 GLMPQ8WWB7 406 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 U3KQE9 123 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 OR11H12B2RN74 326 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 SMLR1H3BR10 107 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 H3BRN7 92 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 BUB3O43684 328 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 GALR1P47211 349 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 Q6ZNX1 250 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 AQP10Q96PS8 301 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 UHRF2Q96PU4 802 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 PFDN5Q99471 154 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 ARV1Q9H2C2 271 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 RNF24Q9Y225 148 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-211ENST00000478693 ZNF98A6NK75 572 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 ARPC5O15511 151 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 PLP1P60201 277 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 ZNF266Q14584 549 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 LEMD1Q68G75 181 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 DEFB125Q8N687 156 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 NRN1Q9NPD7 142 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 PRR20EP86478 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 PRR20CP86479 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 PRR20DP86480 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 PRR20BP86481 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 PRR20AP86496 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 Q8N1Y9 231 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 GPR82Q96P67 336 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 RSG1Q9BU20 258 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 ZNF688P0C7X2 276 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 PATE2Q6UY27 113 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 MFFQ9GZY8 342 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 WFDC1Q9HC57 220 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 RNF222A6NCQ9 220 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 G3V3Q6 166 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-211ENST00000478693 K7EQG2 157 aa8.49□□□□□ -1.05
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