RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473883.5

HCLS1-205, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 2,710 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-205	ENST00000473883	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
HCLS1-205	ENST00000473883	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HCLS1-205	ENST00000473883	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	C15orf61	A6NNL5	157 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	C17orf51	A8MQB3	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	EPM2A	B3EWF7	344 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	LINC01619	G3V211	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	LINC00311	Q8N616	119 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	DSCR8	Q96T75	97 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	MYO9B	Q13459	2157 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	SPINT2	O43291	252 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	PMAIP1	Q13794	54 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	NABP1	Q96AH0	204 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883		M0QZQ0	153 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	LMO2	P25791	158 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	LEP	P41159	167 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	CCL14	Q16627	93 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883		K7EQS6	105 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	MGST3	O14880	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	CXCL13	O43927	109 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	CLDN14	O95500	239 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	CISD3	P0C7P0	127 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	MFAP2	P55001	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	SLC25A45	Q8N413	288 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	CYYR1	Q96J86	154 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883		H3BP45	60 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	COX6A1	P12074	109 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	TDH	Q8IZJ6	230 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	C5orf63	A6NC05	138 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	C1orf105	O95561	183 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	NPY	P01303	97 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	GLI4	P10075	376 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	DYSF	O75923	2080 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883		A0A1B0GXF2	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	HSPB6	O14558	160 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	LTA	P01374	205 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	EFNA4	P52798	201 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	SRY	Q05066	204 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	GPHA2	Q96T91	129 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	FGF22	Q9HCT0	170 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	hADV29S1	A0JD25	119 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	TCL1B	O95988	128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883		Q8N1Y9	231 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	TEX22	C9J3V5	150 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	AVP	P01185	164 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	RITA1	Q96K30	269 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	GNG12	Q9UBI6	72 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	FXYD3	Q14802	87 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	PMS2CL	Q68D20	193 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	SMIM14	Q96QK8	99 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883		A0A0U1RQV1	116 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	ELANE	P08246	267 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883		P0DMU3	169 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	FAM231A	P0DMU4	169 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	FAM231C	P0DMU5	169 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	OR5AS1	Q8N127	324 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	PDF	Q9HBH1	243 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883		R4GMQ9	66 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	LGALS9	O00182	355 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	SYNGR2	O43760	224 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	FXYD4	P59646	89 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	CENPW	Q5EE01	88 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HCLS1-205	ENST00000473883	PDPN	Q86YL7	162 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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