RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 G3V318 75 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 OR2B3O76000 313 aa-1.38□□□□□ -2.63
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SHQ1-204ENST00000468347 CASQ1P31415 396 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 HIST1H2BBP33778 126 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 UGT2B10P36537 528 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 RANBP1P43487 201 aa-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 H2BFSP57053 126 aa-1.38□□□□□ -2.63
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SHQ1-204ENST00000468347 LIMS4P0CW20 117 aa-1.4□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 ARR3P36575 388 aa-1.4□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 EMX2Q04743 252 aa-1.4□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 TSNQ15631 228 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 IQCJQ1A5X6 159 aa-1.4□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-1.4□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 Q6ZRX8 168 aa-1.4□□□□□ -2.63
SHQ1-204ENST00000468347 PID1Q7Z2X4 250 aa-1.4□□□□□ -2.63
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