RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 Q8WTZ3 238 aa7.4□□□□□ -1.22
SRPRB-202ENST00000466636 FXYD5Q96DB9 178 aa7.4□□□□□ -1.22
SRPRB-202ENST00000466636 OR4F4Q96R69 305 aa7.4□□□□□ -1.22
SRPRB-202ENST00000466636 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.4□□□□□ -1.22
SRPRB-202ENST00000466636 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.4□□□□□ -1.22
SRPRB-202ENST00000466636 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SRPRB-202ENST00000466636 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.4□□□□□ -1.22
SRPRB-202ENST00000466636 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.4□□□□□ -1.22
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM160Q9NX00 188 aa7.4□□□□□ -1.22
SRPRB-202ENST00000466636 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SRPRB-202ENST00000466636 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.4□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM89A2RUT3 159 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TGOLN2O43493 480 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 IL4P05112 153 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 CLEC3BP05452 202 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 OR10J4P0C629 311 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 PYYP10082 97 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 GP9P14770 177 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 NPPCP23582 126 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TPPP2P59282 170 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 CST9LP1Q5W188 147 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 USMG5Q96IX5 58 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 PAXXQ9BUH6 204 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 KLK15Q9H2R5 256 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 OR51M1Q9H341 326 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.39□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1W2PRE2 83 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 F6UZH7 168 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 H3BQ15 152 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 PDE6DO43924 150 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 SNAPINO95295 136 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 IGHG4P01861 327 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 PF4V1P10720 104 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 HNF1AP20823 631 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 CEBPGP53567 150 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 LEMD1Q68G75 181 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 C11orf52Q96A22 123 aa7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 PLXNB1O43157 2135 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 GGTLC3B5MD39 225 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 PSMB8P28062 276 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 MYCNOSP40205 109 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 RAB9AP51151 201 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 AWAT1Q58HT5 328 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 LCE2CQ5TA81 110 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 DUX5Q96PT3 197 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 SMR3AQ99954 134 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 PARLQ9H300 379 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 VPS13CQ709C8 3753 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 CREBBPQ92793 2442 aa7.37□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 A0A0G2JLM5 398 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF98A6NK75 572 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF727A8MUV8 499 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 PPP5D1E7EU14 171 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 LY6G6DO95868 133 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV12-3P01733 135 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ARL3P36405 182 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF329Q86UD4 541 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 GNB4Q9HAV0 340 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ESM1Q9NQ30 184 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 CLDN34H7C241 214 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 M0R036 132 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 BMPR1BO00238 502 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFB4O95168 129 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3-11P01762 117 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 IGLC2P0DOY2 106 aa7.35□□□□□ -1.23
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