RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 DDTP30046 118 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 WT1-ASQ06250 92 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 REC114Q7Z4M0 266 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 MMD2Q8IY49 270 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 OCC1Q8TAD7 63 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 ACTL6BO94805 426 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 TAS2R45P59539 299 aa14.69□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 NDPQ00604 133 aa14.69□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.69□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 RNF2Q99496 336 aa14.69□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.69□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 HIVEP1P15822 2718 aa14.69□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 CNIH1O95406 144 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 AMY1AP04745 511 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 BPIFB3P59826 476 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 CX3CL1P78423 397 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 LINC01548A6NM66 108 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 OR5G3P0C626 314 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 TEX22C9J3V5 150 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 LY6G6DO95868 133 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 FXYD3Q14802 87 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 C14orf144Q96I85 54 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 TNCP24821 2201 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 A6NDX4 124 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 OR10J4P0C629 311 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 IER3P46695 156 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 SELENOTP62341 195 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF90Q03938 601 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 CD69Q07108 199 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 IQCJQ1A5X6 159 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 DUX5Q96PT3 197 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1W2PN81 502 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 RPEL1Q2QD12 228 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 COX19Q49B96 90 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 C1RLQ9NZP8 487 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1W2PRE2 83 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 K7EN84 100 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 OR10J1P30954 320 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 Q6YL49 198 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 Q6ZS46 218 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 HELTA6NFD8 242 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 BLCAPP62952 87 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 MLANAQ16655 118 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 PRO1933Q9H354 126 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.64□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 PLXNB1O43157 2135 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 C8orf88P0DMB2 117 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ADMP35318 185 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 GNG4P50150 75 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 OSTCQ9NRP0 149 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 HLA-DRB1P01911 266 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 MFAP2P55001 183 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ARPC1AQ92747 370 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 A8MWP6 167 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ESDP10768 282 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 PAFAH1B2P68402 229 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 TIGITQ495A1 244 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF664Q8N3J9 261 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 V9GYV3 84 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 MTORP42345 2549 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms