RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP54-210ENST00000466048 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 YPEL2Q96QA6 119 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 A0A1B0GUT8 65 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PS18 150 aa6.29□□□□□ -1.4
USP54-210ENST00000466048 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.29□□□□□ -1.4
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USP54-210ENST00000466048 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 ID1P41134 155 aa6.26□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 PEX7O00628 323 aa6.25□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.25□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 SGK494Q96LW2 274 aa6.25□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 GPR82Q96P67 336 aa6.25□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.25□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.25□□□□□ -1.41
USP54-210ENST00000466048 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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