RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463724.1

LRRIQ3-208, Transcript of leucine rich repeats and IQ motif containing 3, human

TSL 1 (best)

Gene LRRIQ3, Length 3,614 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRIQ3-208	ENST00000463724	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724		D6R8Y8	96 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	PTH2	Q96A98	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	ASCL2	Q99929	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	COL4A2	P08572	1712 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	PI4KA	P42356	2102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724		E9PLD3	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	SCRG1	O75711	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	GAGE7	O76087	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	IL4	P05112	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	CD27	P26842	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	ID1	P41134	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	GAGE4	Q13068	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	SPEG	Q15772	3267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	SNCG	O76070	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	AGRN	O00468	2067 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	PRTN3	P24158	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	FOXC2	Q99958	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	CKS2	P33552	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724		Q8TCH9	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	PRRG2	O14669	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	CRYGC	P07315	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	IGKC	P01834	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	ZNF146	Q15072	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	COQ2	Q96H96	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	NDUFS7	O75251	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	RPE	Q96AT9	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724		Q6AWC8	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRIQ3-208	ENST00000463724	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms