RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKR1C2P52895 323 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIGITQ495A1 244 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR4A5Q8NH83 315 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPIN2AQ99865 258 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 I3L521 148 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNAPC5O75971 98 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 P0C879 139 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR13C7P0DN81 318 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMB6P28072 239 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD40LGP29965 261 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAS1LP35410 378 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RHOGP84095 191 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WT1-ASQ06250 92 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1R1AQ13522 171 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR11H1Q8NG94 326 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BATF3Q9NR55 127 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF24Q9Y225 148 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WRBO00258 174 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFITM3Q01628 133 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC35G3Q8N808 338 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8NBF4 154 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR146Q96CH1 333 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 P2RX4Q99571 388 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP5D1E7EU14 171 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LYRM1O43325 122 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFB6O95139 128 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDS2O95674 445 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-48P01763 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFA4P12838 97 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTRB1P17538 263 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYCNOSP40205 109 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP5G2Q06055 141 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF616Q08AN1 781 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C15orf32Q32M92 178 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCUN1D4Q92564 292 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRNDQ9UKY0 176 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CENPXA8MT69 81 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC01619G3V211 115 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BUA1 57 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFNA17P01571 189 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRYGCP07315 174 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF846Q147U1 533 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UQCC3Q6UW78 93 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S100ZQ8WXG8 99 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALNT14Q96FL9 552 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM56Q96MV1 263 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC32Q9BV29 185 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUDT15Q9NV35 164 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0G2JLM5 398 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UPK1BO75841 260 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SFT2D2O95562 160 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms