RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 COX6A1P12074 109 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 GCSHP23434 173 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-203ENST00000439720 PRR20CP86479 221 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR20DP86480 221 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR20BP86481 221 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR20AP86496 221 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10D3Q8NH80 312 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 NMUP48645 174 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-203ENST00000439720 MOB3BQ86TA1 216 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF747Q9BV97 191 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MWL6 223 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 NBR2O15453 112 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 WISP2O76076 250 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 MALP21145 153 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-203ENST00000439720 GNG3P63215 75 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 CHEK1O14757 476 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 MGST3O14880 152 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 EYSQ5T1H1 3165 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF292O60281 2723 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EMI3 77 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 SCRG1O75711 98 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 FXYD2P54710 66 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 RFESDQ8TAC1 157 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8TCH9 128 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 TCF19Q9Y242 345 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 NKX2-8O15522 239 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN13O95857 204 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 GNG5P63218 68 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 MORN5Q5VZ52 161 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 GTSF1Q8WW33 167 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF183Q96D59 192 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.78□□□□□ -1.32
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RABGEF1-203ENST00000439720 STHQ8IWL8 128 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 C20orf78Q9BR46 151 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.78□□□□□ -1.32
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RABGEF1-203ENST00000439720 FRYLO94915 3013 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX22C9J3V5 150 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 F5H768 121 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX7O00628 323 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 TFF1P04155 84 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-203ENST00000439720 PYYP10082 97 aa6.78□□□□□ -1.32
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RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PRM7 423 aa6.77□□□□□ -1.33
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RABGEF1-203ENST00000439720 ERVK-16P61578 105 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNG7P62955 275 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 AMTNQ6UX39 209 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR31Q8NA23 367 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.77□□□□□ -1.33
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