RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439555.2

IRF1-204, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene IRF1, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-204ENST00000439555 NEU1Q99519 415 aa8.29□□□□□ -1.08
IRF1-204ENST00000439555 DNAH2Q9P225 4427 aa8.28□□□□□ -1.08
IRF1-204ENST00000439555 C9orf170A2RU37 121 aa8.28□□□□□ -1.08
IRF1-204ENST00000439555 ISLRO14498 428 aa8.28□□□□□ -1.08
IRF1-204ENST00000439555 SOCS3O14543 225 aa8.28□□□□□ -1.08
IRF1-204ENST00000439555 NDUFB6O95139 128 aa8.28□□□□□ -1.08
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IRF1-204ENST00000439555 HLA-DMBP28068 263 aa8.28□□□□□ -1.08
IRF1-204ENST00000439555 MEOX2P50222 304 aa8.28□□□□□ -1.08
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IRF1-204ENST00000439555 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.28□□□□□ -1.08
IRF1-204ENST00000439555 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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IRF1-204ENST00000439555 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
IRF1-204ENST00000439555 APLNQ9ULZ1 77 aa8.27□□□□□ -1.09
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IRF1-204ENST00000439555 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
IRF1-204ENST00000439555 IFNA21P01568 189 aa8.26□□□□□ -1.09
IRF1-204ENST00000439555 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
IRF1-204ENST00000439555 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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IRF1-204ENST00000439555 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.26□□□□□ -1.09
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IRF1-204ENST00000439555 C12orf74Q32Q52 190 aa8.24□□□□□ -1.09
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IRF1-204ENST00000439555 AKR1C1Q04828 323 aa8.23□□□□□ -1.09
IRF1-204ENST00000439555 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
IRF1-204ENST00000439555 MITD1Q8WV92 249 aa8.23□□□□□ -1.09
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IRF1-204ENST00000439555 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.23□□□□□ -1.09
IRF1-204ENST00000439555 PSENENQ9NZ42 101 aa8.23□□□□□ -1.09
IRF1-204ENST00000439555 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.23□□□□□ -1.09
IRF1-204ENST00000439555 RNF24Q9Y225 148 aa8.23□□□□□ -1.09
IRF1-204ENST00000439555 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.22□□□□□ -1.09
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