RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 LY6G6CO95867 125 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 IFNA21P01568 189 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 IGKV3-20P01619 116 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 FABP1P07148 127 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 SPP1P10451 314 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 FXYD7P58549 80 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 LINC00052Q96N35 136 aa10.05□□□□□ -0.8
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A22Q9H936 323 aa10.05□□□□□ -0.8
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PRAME-209ENST00000439106 X6R8D5 127 aa10.05□□□□□ -0.8
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PRAME-209ENST00000439106 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.04□□□□□ -0.8
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PRAME-209ENST00000439106 SLC25A32Q9H2D1 315 aa10.04□□□□□ -0.8
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PRAME-209ENST00000439106 LINC00869P0C866 280 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
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PRAME-209ENST00000439106 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa10□□□□□ -0.81
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PRAME-209ENST00000439106 OR4B1Q8NGF8 309 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 S100ZQ8WXG8 99 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 UHRF2Q96PU4 802 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 RSG1Q9BU20 258 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 TMEM147Q9BVK8 224 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-209ENST00000439106 H3BRN7 92 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 GALR1P47211 349 aa9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF846Q147U1 533 aa9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-209ENST00000439106 CCDC32Q9BV29 185 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-209ENST00000439106 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 K7EPK0 472 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 ISLRO14498 428 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 TSC22D2O75157 780 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 DEDDO75618 318 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
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