RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430081.5

OPTN-208, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 5

Gene OPTN, Length 848 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-208ENST00000430081 MCUBQ9NWR8 336 aa7.25□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.25□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 BUB3O43684 328 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 NUDT3O95989 172 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 RD3LP0DJH9 198 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 NMSQ5H8A3 153 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 DTD1Q8TEA8 209 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 IL22RA2Q969J5 263 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 EPM2AB3EWF7 344 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 TOMM40O96008 361 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 DEFB1P60022 68 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 SMCO1Q147U7 214 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 NOXA1Q86UR1 476 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 ZNF709Q8N972 641 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 RBKSQ9H477 322 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 A0A0B4J2A0 478 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 LYRM9A8MSI8 78 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 F5H768 121 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 PSG1P11464 419 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 TNFSF8P32971 234 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 PSMB3P49720 205 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 CCR6P51684 374 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 TMBIM6P55061 237 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 CLINT1Q14677 625 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 FAM78BQ5VT40 261 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 LGI3Q8N145 548 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 OR1S1Q8NH92 325 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 RNF125Q96EQ8 232 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 AGRNO00468 2067 aa7.21□□□□□ -1.25
OPTN-208ENST00000430081 FABP12A6NFH5 140 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 ZFP92A6NM28 416 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 H3BMQ9 156 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 DEFB130BP0DP73 79 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 DEFB130AP0DP74 79 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 IAPPP10997 89 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 ANXA3P12429 323 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 LYZP61626 148 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SRPXP78539 464 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 ZNF90Q03938 601 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 ZNF79Q15937 498 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 MCFD2Q8NI22 146 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 U3KQ87 197 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 VAMP1P23763 118 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PAX9P55771 341 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 GAMTQ14353 236 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 TTC32Q5I0X7 151 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SLC35E1Q96K37 410 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 Q9H8V8 135 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 RPRMQ9NS64 109 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 A0A0J9YX75 114 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 F6UB75 175 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 ISLRO14498 428 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 ATP5G1P05496 136 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 ATP5G3P48201 142 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 B2MP61769 119 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 OR2F1Q13607 317 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 PYDC2Q56P42 97 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SSX7Q7RTT5 188 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 TRIM63Q969Q1 353 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 C16orf92Q96LL3 132 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-208ENST00000430081 SOSTQ9BQB4 213 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.3 ms