RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 REC114Q7Z4M0 266 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1QL4Q86Z23 238 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAX2Q96IS3 184 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 RABAC1Q9UI14 185 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 UFC1Q9Y3C8 167 aa12.98□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF320A2RRD8 509 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7EMT4 169 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGS13O14921 159 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPPCP23582 126 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00305Q7Z4B0 112 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM213BQ8TBF2 198 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL26Q96S19 204 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 C20orf24Q9BUV8 137 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF747Q9BV97 191 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 FUT9Q9Y231 359 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 NF1P21359 2839 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYBB3P26998 211 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYCNOSP40205 109 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 FHITP49789 147 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 BLOC1S1P78537 153 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM122CQ6P4D5 195 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 A8MWP6 167 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYNJ2BPP57105 145 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAS2R45P59539 299 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 C12orf54Q6X4T0 127 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB24Q969Q5 203 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUX3Q96PT4 197 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 UHRF2Q96PU4 802 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A22Q9H936 323 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2CD3Q4AC94 2353 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BRN7 92 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 H2AFB1P0C5Y9 115 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLURP1P55000 103 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB14P61106 215 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF726P1Q15940 193 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 C3orf56Q8N813 242 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 PEMTQ9UBM1 199 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX46H3BTG2 121 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 C8orf88P0DMB2 117 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 STXBP6Q8NFX7 210 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4F17Q8NGA8 305 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBD3L1Q8WWY6 194 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4F4Q96R69 305 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 U3KQE9 123 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PS18 150 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF98A6NK75 572 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 STAG3L2P0CL84 134 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 STAG3L3P0CL85 134 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 BMI1P35226 326 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TM4SF20Q53R12 229 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 KHDC3LQ587J8 217 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf194Q5T5A4 169 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 MIR17HGQ75NE6 70 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SFT2D1Q8WV19 159 aa12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 BUB3O43684 328 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 HBE1P02100 147 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 MORN5Q5VZ52 161 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 PQLC2Q6ZP29 291 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSX7Q7RTT5 188 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR9G4Q8NGQ1 327 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 MARC2Q969Z3 335 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRAMD2BQ96HH9 432 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCRT1Q9BWW7 348 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM231Q9H6L2 316 aa12.92□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 JMJD1CQ15652 2540 aa12.91□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM213A2RRL7 107 aa12.91□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXorf1O96002 111 aa12.91□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 PF4P02776 101 aa12.91□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 NMBP08949 121 aa12.91□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLLU1Q5K131 121 aa12.91□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCN15Q6UWW0 184 aa12.91□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa12.91□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR82Q96P67 336 aa12.91□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMPXQ9UHP9 88 aa12.91□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV5A0A0B4J249 113 aa12.9□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 LEMD1Q68G75 181 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms