RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 C4BPBP20851 252 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 PATE2Q6UY27 113 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 IL34Q6ZMJ4 242 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 UHRF2Q96PU4 802 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 NOTCH3Q9UM47 2321 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 BAP18Q8IXM2 172 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 OR2G3Q8NGZ4 309 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 ST8SIA2Q92186 375 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 HIGD1AQ9Y241 93 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 K7EMT4 169 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 CSN3P07498 182 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 NPPCP23582 126 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM37Q8WXS4 190 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 VSIRQ9H7M9 311 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 CMYA5Q8N3K9 4069 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa21.42■■□□□ 1.02
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GIPC1-202ENST00000393028 CD33P20138 364 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 CRYBB3P26998 211 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 RAB2AP61019 212 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 FOLR2P14207 255 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 PXDC1Q5TGL8 231 aa21.41■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 C10orf113Q5VZT2 155 aa21.41■■□□□ 1.02
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GIPC1-202ENST00000393028 OR1L4Q8NGR5 311 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 TMED6Q8WW62 240 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 ELOVL1Q9BW60 279 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 SCRT1Q9BWW7 348 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa21.4■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 LEMD1Q68G75 181 aa21.39■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 PFDN5Q99471 154 aa21.39■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 SMPXQ9UHP9 88 aa21.39■■□□□ 1.02
GIPC1-202ENST00000393028 SEC14L6B5MCN3 397 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 H3BRN7 92 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 SAP30O75446 220 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 MORN5Q5VZ52 161 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa21.39■■□□□ 1.01
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GIPC1-202ENST00000393028 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 U3KQE9 123 aa21.39■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 SERF2P84101 59 aa21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 CHEK1O14757 476 aa21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 SEC11BP0C7V7 166 aa21.37■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 C8orf88P0DMB2 117 aa21.37■■□□□ 1.01
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GIPC1-202ENST00000393028 SLC25A22Q9H936 323 aa21.37■■□□□ 1.01
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GIPC1-202ENST00000393028 WFDC9Q8NEX5 89 aa21.36■■□□□ 1.01
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GIPC1-202ENST00000393028 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa21.35■■□□□ 1.01
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GIPC1-202ENST00000393028 OR10G4Q8NGN3 311 aa21.35■■□□□ 1.01
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GIPC1-202ENST00000393028 OR10G7Q8NGN6 311 aa21.35■■□□□ 1.01
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GIPC1-202ENST00000393028 IGLL1P15814 213 aa21.34■■□□□ 1.01
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GIPC1-202ENST00000393028 TRAV5A0A0B4J249 113 aa21.33■■□□□ 1.01
GIPC1-202ENST00000393028 A0A1W2PS18 150 aa21.32■■□□□ 1
GIPC1-202ENST00000393028 C16orf54Q6UWD8 224 aa21.32■■□□□ 1
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GIPC1-202ENST00000393028 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
GIPC1-202ENST00000393028 FHITP49789 147 aa21.3■■□□□ 1
GIPC1-202ENST00000393028 C9orf66Q5T8R8 295 aa21.3■■□□□ 1
GIPC1-202ENST00000393028 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
GIPC1-202ENST00000393028 SSX7Q7RTT5 188 aa21.3■■□□□ 1
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