RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 SPRY4Q9C004 299 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-201ENST00000389757 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-201ENST00000389757 SYNJ2BPP57105 145 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-201ENST00000389757 CACNG7P62955 275 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-201ENST00000389757 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.33□□□□□ -1.08
PKP4-201ENST00000389757 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PKP4-201ENST00000389757 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.33□□□□□ -1.08
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PKP4-201ENST00000389757 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.33□□□□□ -1.08
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PKP4-201ENST00000389757 STAG3L3P0CL85 134 aa8.33□□□□□ -1.08
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PKP4-201ENST00000389757 A0A1B0GX30 115 aa8.32□□□□□ -1.08
PKP4-201ENST00000389757 TMEM50AO95807 157 aa8.32□□□□□ -1.08
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PKP4-201ENST00000389757 CFPP27918 469 aa8.32□□□□□ -1.08
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PKP4-201ENST00000389757 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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PKP4-201ENST00000389757 CFAP161Q6P656 301 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-201ENST00000389757 Q6ZRM9 215 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-201ENST00000389757 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.29□□□□□ -1.08
PKP4-201ENST00000389757 OCC1Q8TAD7 63 aa8.29□□□□□ -1.08
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