RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV2-70P01814 119 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 NMSQ5H8A3 153 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 LCN12Q6JVE5 192 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 CD28P10747 220 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 PATE3B3GLJ2 98 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 LY6EQ16553 131 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 GAGE1Q13065 139 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 MST1P26927 711 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 OR9G9P0C7N8 305 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 TDGF1P13385 188 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 MALP21145 153 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 GFRA3O60609 400 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 NBR2O15453 112 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 LHX2P50458 406 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 C2orf82Q6UX34 121 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 FOXH1O75593 365 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 CRPP02741 224 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 WBP1Q96G27 269 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM86BQ8N661 226 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01587Q99440 93 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 PSG7Q13046 419 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 RHOGP84095 191 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 PSG3Q16557 428 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 SAP25Q8TEE9 199 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 CELA3BP08861 270 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 TIAF1O95411 115 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 EFEMP2O95967 443 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 Q0VG73 95 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 PTPN13Q12923 2485 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 NOTCH4Q99466 2003 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 LYPD3O95274 346 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 F8W1H4 67 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 CDKN1AP38936 164 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 MYOD1P15172 320 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-204ENST00000373190 UCNP55089 124 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 CITED1Q99966 193 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 BSPH1Q075Z2 132 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 TRGV9Q99603 122 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 CD33P20138 364 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 FAM166AQ6J272 317 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 NCR2O95944 276 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 MLNRO43193 412 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV1-2P23083 117 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 CELA3AP09093 270 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 FAM201AQ5SY85 155 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 ITGB1BP1O14713 200 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 TCRAP04437 139 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 DPH3Q96FX2 82 aa7.26□□□□□ -1.25
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