RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 SAP30O75446 220 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 K7ENP7 123 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 CSN3P07498 182 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 APELAP0DMC3 54 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 UQCRFS1P47985 274 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 ZNF138P52744 262 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 GNG5P63218 68 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 RASL11AQ6T310 242 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 PPIAL4DF5H284 164 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 CFHR2P36980 270 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 AP1S3Q96PC3 154 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 JPT1Q9UK76 154 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 PEX7O00628 323 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 CGB3P0DN86 165 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 CGB7P0DN87 165 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 RTL8BQ17RB0 113 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-201ENST00000317907 C7orf71A4D174 169 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 GAGE10A6NGK3 116 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 VWC2LB2RUY7 222 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 E7EQL1 145 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 TCTAP57738 103 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 HBBP68871 147 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 BLNKQ8WV28 456 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 FLNCQ14315 2725 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 TMEM238C9JI98 176 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 COX7A2P2O60397 106 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 MBD6Q96DN6 1003 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 PAXXQ9BUH6 204 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 F2RL2O00254 374 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 OR2J3O76001 311 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 SMIM12Q96EX1 92 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 CHEK1O14757 476 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 CD5LO43866 347 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 GPR183P32249 361 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 KIR2DS2P43631 304 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 CT45A6P0DMU7 189 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 CT45A5P0DMU8 189 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 CT45A7P0DMV0 189 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 TNFRSF1AP19438 455 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 GATA4P43694 442 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.57□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 CCL21O00585 134 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 E7EUB6 86 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 TMEM11P17152 192 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 HTR1DP28221 377 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 ARF6P62330 175 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 LY6DQ14210 128 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 ZNF329Q86UD4 541 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 RITA1Q96K30 269 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 CTSZQ9UBR2 303 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 PRNDQ9UKY0 176 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.044e-7■■■■□ 26.5
TTC27-201ENST00000317907 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 FAM231BA6NCW3 169 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 SHISA9B4DS77 424 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC27-201ENST00000317907 HLA-DRB1P01911 266 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms