RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 PLP1P60201 277 aa13.89□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 GPHB5Q86YW7 130 aa13.89□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 ZFAND3Q9H8U3 227 aa13.89□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP13.89□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 YIF1AO95070 293 aa13.88□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 RPEL1Q2QD12 228 aa13.88□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 PXDC1Q5TGL8 231 aa13.88□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 TOMM20LQ6UXN7 152 aa13.88□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 TMED6Q8WW62 240 aa13.88□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.87□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 Q6ZRG5 221 aa13.87□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 RNF125Q96EQ8 232 aa13.87□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 B9D2Q9BPU9 175 aa13.87□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 SAP30O75446 220 aa13.86□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 IL4P05112 153 aa13.86□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 TMEM190Q8WZ59 177 aa13.86□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 TENM3Q9P273 2699 aa13.86□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 ELLP55199 621 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 LYZP61626 148 aa13.85□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 FAM106AQ4KMX7 169 aa13.85□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 TEX261Q6UWH6 196 aa13.85□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.85□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.85□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 UMAD1C9J7I0 102 aa13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 LGALS9O00182 355 aa13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 HYPMO75409 117 aa13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 MBP02144 154 aa13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 M6PRP20645 277 aa13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 PATE2Q6UY27 113 aa13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 TMEM37Q8WXS4 190 aa13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 PFDN5Q99471 154 aa13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
PTX4-201ENST00000293922 ORM2P19652 201 aa13.83□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 ALKAL2Q6UX46 152 aa13.83□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 OR1L4Q8NGR5 311 aa13.83□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 OR1B1Q8NGR6 318 aa13.83□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 GATAD1Q8WUU5 269 aa13.83□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 PBDC1Q9BVG4 233 aa13.83□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 VSIRQ9H7M9 311 aa13.83□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.83□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 RPRMQ9NS64 109 aa13.83□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 SORL1Q92673 2214 aa13.83□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 A8MWP6 167 aa13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 COX7A2P2O60397 106 aa13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 SYNJ2BPP57105 145 aa13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 RAB2AP61019 212 aa13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 TMEM41BQ5BJD5 291 aa13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 ZNF680Q8NEM1 530 aa13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 C20orf24Q9BUV8 137 aa13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 DOK5Q9P104 306 aa13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 ZNF320A2RRD8 509 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 K7EMT4 169 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 OR5G3P0C626 314 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 SULT1A2P50226 295 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 RAB5CP51148 216 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 C10orf113Q5VZT2 155 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 OR10G4Q8NGN3 311 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 OR10G9Q8NGN4 311 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 OR10G7Q8NGN6 311 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 RABAC1Q9UI14 185 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 HIGD1AQ9Y241 93 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 UFC1Q9Y3C8 167 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 STAB2Q8WWQ8 2551 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 CRYBB3P26998 211 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 IFITM2Q01629 132 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 METTL26Q96S19 204 aa13.81□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 IFNA7P01567 189 aa13.8□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.8□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.8□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 S100A7AQ86SG5 101 aa13.8□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 UHRF2Q96PU4 802 aa13.8□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 RNF2Q99496 336 aa13.8□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 ELOVL1Q9BW60 279 aa13.8□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 U3KQE9 123 aa13.8□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 TMEM213A2RRL7 107 aa13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 H3BRN7 92 aa13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 NPPCP23582 126 aa13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 S100A7P31151 101 aa13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 RHOBP62745 196 aa13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 FAM78BQ5VT40 261 aa13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 IL34Q6ZMJ4 242 aa13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 LINC00305Q7Z4B0 112 aa13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
PTX4-201ENST00000293922 FUT9Q9Y231 359 aa13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.8 ms