RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0D9SG52 128 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF320A2RRD8 509 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFA4O00483 81 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 AGPAT2O15120 278 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TOMM40O96008 361 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 FABP1P07148 127 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 RD3LP0DJH9 198 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 PSG1P11464 419 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 CAMLGP49069 296 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 RAB31Q13636 194 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TMUB2Q71RG4 321 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 GPHB5Q86YW7 130 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 C1QL4Q86Z23 238 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 Q8WTZ3 238 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ARL6Q9H0F7 186 aa6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TAAR5O14804 337 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 BCL2L11O43521 198 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 MPDU1O75352 247 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 IL4P05112 153 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF266Q14584 549 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 VWFP04275 2813 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 LGALS9O00182 355 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 OVOL1O14753 267 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00869P0C866 280 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 LYZP61626 148 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 SELENOTP62341 195 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 MIC13Q5XKP0 118 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 REC114Q7Z4M0 266 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 STPG3Q8N7X2 389 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF709Q8N972 641 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 RNF125Q96EQ8 232 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 GINS3Q9BRX5 216 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 RSG1Q9BU20 258 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 PEMTQ9UBM1 199 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 A8MWP6 167 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 JTBO76095 146 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ORM2P19652 201 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 EDN2P20800 178 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 B2MP61769 119 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 OPCMLQ14982 345 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TM4SF20Q53R12 229 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 METTL26Q96S19 204 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 DOK5Q9P104 306 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 RABAC1Q9UI14 185 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 RFNGQ9Y644 331 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.49□□□□□ -1.37
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