RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 hADV29S1A0JD25 119 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 TCRAP04437 139 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 Q6ZT83 130 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM201AQ5SY85 155 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 RAMP3O60896 148 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 RASL10AQ92737 203 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 C5orf47Q569G3 176 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 C1QTNF9P0C862 333 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 PAX8Q06710 450 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 LCNL1Q6ZST4 164 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 PSG8Q9UQ74 426 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 IGHV3-53P01767 116 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SS18Q15532 418 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 ACACAQ13085 2346 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF876PQ49A33 203 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 C1QL4Q86Z23 238 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAV25A0A0B4J276 109 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 TRACP01848 142 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 PSG3Q16557 428 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 DEPPQ9NTK1 212 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 D6R8Y8 96 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SAP30O75446 220 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 GUSBP1Q15486 140 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 DSCR8Q96T75 97 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 IGHMP01871 453 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 C1QCP02747 245 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 PYYP10082 97 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 COX5BP10606 129 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 hDV102S1A0JD36 115 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 MESP2Q0VG99 397 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 LILRA6Q6PI73 481 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 GAGE12BA1L429 117 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 ACTL10Q5JWF8 245 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 PVRIGQ6DKI7 326 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PRE2 83 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 VWA8A3KMH1 1905 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 THAP8Q8NA92 274 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRJ-207ENST00000613246 DUTP33316 252 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 CRIM1Q9NZV1 1036 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 SMPXQ9UHP9 88 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 SPXQ9BT56 116 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 SOCS3O14543 225 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 LHBP01229 141 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 OSTCQ9NRP0 149 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 LINC01549A6NIU2 74 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 C12orf77C9JDV5 145 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf159Q96HA4 380 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2BKO60814 126 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2BJP06899 126 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2BOP23527 126 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2BBP33778 126 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2BDP58876 126 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2BCP62807 126 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST2H2BEQ16778 126 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2BHQ93079 126 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 SPSB2Q99619 263 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2BNQ99877 126 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H2BMQ99879 126 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 MLNRO43193 412 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 IGHG3P01860 377 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 LINC01559Q495D7 138 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 SMRP1Q8NCR6 262 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 SELLP14151 372 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 C15orf61A6NNL5 157 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM27E3Q08E93 113 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 OCC1Q8TAD7 63 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 PSG1P11464 419 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 COX6A1P12074 109 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 KIR3DS1Q14943 382 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 IFITM2Q01629 132 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM144Q7Z5S9 345 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRJ-207ENST00000613246 INAFM2P0DMQ5 153 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms