RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 MLNRO43193 412 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 CKS1BP61024 79 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 PAX8Q06710 450 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 LINC01549A6NIU2 74 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 NDUFS8O00217 210 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 ERG28Q9UKR5 140 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 EFNA2O43921 213 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 M0R2P5 195 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 HTN3P15516 51 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 GGNQ86UU5 652 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 ATXN8Q156A1 80 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 RFNGQ9Y644 331 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 IGKV1-5P01602 117 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 SPTBP11277 2137 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 LYNX1G3V0Z9 82 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 NCR2O95944 276 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 LYNX1P0DP58 116 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 TRGV9Q99603 122 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 LYL1P12980 280 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 FOXF2Q12947 444 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 NUP35Q8NFH5 326 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 CLPSP04118 112 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 TMEM200BQ69YZ2 307 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 hDV102S1A0JD36 115 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 DLEU1O43261 78 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.84□□□□□ -0.83
TNS1-220ENST00000611415 PSG1P11464 419 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 SRD5A1P18405 259 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 CD177Q8N6Q3 437 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TMEM238C9JI98 176 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 GUSBP1Q15486 140 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TCRAP04437 139 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 PRR31Q5SQ13 230 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 SRRM5B3KS81 715 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 SH2D1AO60880 128 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 QRFPP83859 136 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 CFHR1Q03591 330 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 WNT2P09544 360 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 LTBRP36941 435 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 GGTLC3B5MD39 225 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 CD33P20138 364 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 A0A1B0GWJ7 208 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 PSPNO60542 156 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 C3orf79P0CE67 100 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 PSG3Q16557 428 aa9.82□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.81□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 NTF4P34130 210 aa9.81□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 NPC2P61916 151 aa9.81□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.81□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 A0A087X0K7 114 aa9.81□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 LINC00158P58513 81 aa9.81□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.81□□□□□ -0.84
TNS1-220ENST00000611415 FXYD7P58549 80 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms