RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593072.5

EFTUD2-225, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 5

Gene EFTUD2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		G3V3Q6	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TGOLN2	O43493	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IFNA7	P01567	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CRYGC	P07315	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SLC25A6	P12236	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RAP2B	P61225	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RAB32	Q13637	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		Q6ZTC4	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RNF2	Q99496	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	NMES1	Q9C002	83 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		H0YIZ8	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		K7EPK0	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	YIF1A	O95070	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IFNA17	P01571	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	MAS1L	P35410	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	S100A10	P60903	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	S100A12	P80511	92 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	ID3	Q02535	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		Q5BKY6	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RBKS	Q9H477	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PKD1	P98161	4303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	WRB	O00258	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SYNGR2	O43760	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SSSCA1	O60232	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	MPC2	O95563	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM50A	O95807	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IFNA10	P01566	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	FGF2	P09038	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	IAPP	P10997	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	ADM	P35318	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	DEFB131A	P59861	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	SPCS3	P61009	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	RAB14	P61106	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072		Q56UQ5	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms